رایزنی فرهنگی جمهوری اسلامی ایران در اوگاندا شهادت دانشمند هسته ای کشورمان شهید دکتر محسن فخری زاده را به محضرمقام معظم رهبری(مد ظله العالی )، ملت بزرگ و انقلابی ایران ، خانواده محترم آن شهید والامقام ، دانشمندان متعهد به ارزش های انسانی و عموم مسلمانان و آزادگان جهان تبریک و تسلیت گفت.

وزارت خارجه امارات متحده عربی با صدور بیانیه ای ترور شهید «محسن فخری زاده» دانشمند هسته ای ایران را محکوم کرد.  

  وزیر امور خارجه جمهوری آذربایجان در تماسی تلفنی با وزیر امور خارجه کشورمان اقدام تروریستی و غیرانسانی ترور شهید فخری‌زاده را محکوم کرد.  

نماینده ولی فقیه در استان و امام جمعه بوشهر گفت: حاج قاسم سلیمانی سردار دفاع نظامی و شهید محسن فخری زاده سردار علم و نوآوری به ویژه علوم استراتژیک و راهبردی بود.  

آیت الله بیات زنجانی در پی ترور اندیشمند صنعت دفاعی کشور شهید محسن فخری زاده با صدور پیامی تاکید کرد: ترور مدیر عالی‌رتبه و اندیشمند صنعت دفاعی کشور بار دیگر چهرۀ کریه و خشن تروریسم را ظاهر ساخت.  

شماری از طلاب و روحانیون اهل سنت شمال کشور با راه اندازی صفحه یادبود مجازی برای شهید فخری زاده، یاد آن شهید بزرگوار را گرامی داشتند.  

امام جمعه اهل سنت شهر مشهدریزه در استان خراسان رضوی طی پیامی ترور دکتر «محسن فخری‌زاده» دانشمند هسته ای را محکوم کرد.  

جمعی از علمای اهل سنت شهرهای مختلف استان هرمزگان در پیام های جداگانه، ترور بزدلانه شهید محسن فخری زاده را به شدت محکوم کردند.  

آیت الله علوی گرگانی، از مراجع تقلید گفت: ترور محسن فخری زاده به دست جنایتکاران شقاوت پیشه نشانه شدت عصبانیت آنها از پیشرفت علمی ایران اسلامی است.  

مرکز روابط عمومی و اطلاع رسانی وزارت اطلاعات طی اطلاعیه ای اعلام کرد: سرنخ‌هایی از عاملان ترور شهید فخری‌زاده به دست آمده است.  

  جنبش «عصائب اهل الحق» عراق جنایت ترور دکتر «محسن فخری زاده» رییس سازمان پژوهش و نوآوری وزارت دفاع ایران را محکوم و خواهان موضعگیری قاطع جهانی در برابر عاملان آن شد.  

امام جمعه و جماعت مسجد نور و مدرسین و طلاب مدرسه‌‌ علوم دینی نور اهل سنت ارومیه در پیامی ترور شهید فخری زاده را محکوم کردند.  

دانشگاه پیام نور پیرانشهر در پیامی ضمن تسلیت شهادت دکتر محسن فهری زاده، دانشمند هسته ای ایران، این ترور بزدلانه را محکوم کرد.  

رادیو بین المللی چین در تحلیلی با عنوان «ترور دانشمند هسته ای ایران؛ تهدیدی برای صلح خاورمیانه» نوشت: سال ۲۰۲۰ برای ایران سال بسیار تلخی بود در آغاز سال سردار سلیمانی و در پایان سال هم محسن فخری زاده ترور شد.  

  رییس شورای اسلامی شهر مهاباد از توابع شهرستان اردستان گفت: به مناسبت شهادت استاد «محسن فخری‌زاده» دانشمند برجسته‌ هسته‌ای و صنعت دفاعی کشورمان و همزمان با مراسم تشییع و تدفین این شهید در زادگاهش، در این شهر استان اصفهان عزای عمومی اعلام شده است.  

  رهبر جریان «حکمت ملی» عراق در دیدار با سفیر ایران در بغداد ضمن محکومیت جنایت ترور شهید «محسن فخری زاده»، گفت: این دانشمند شهید زندگی خود را وقف مردم کشورش کرد.  

فرمانده سپاه ناحیه مرکزی رشت با اشاره به اینکه هدف اصلی ترور دانشمندان کُند کردن حرکت علمی ایران است، گفت: دشمن بداند سیلی محکمی از ملت ایران خواهد خورد.

ابراهیم ابراهیمی مدرس مدرسه علوم دینی اسماعیلیه قشم گیاهدان و امام جمعه روستای کنارسیاه در پیامی شهادت دانشمندان هسته ای کشورمان شهید فخری زاده را تسلیت گفت.

«انجمن علمای یمن» امروز (یکشنبه) ترور «محسن فخری‌زاده» دانشمند هسته‌ای و دفاعی ایران را محکوم کرد.